ПЦР с определением омикрон-штамма

ПЦР с определением омикрон-штамма
SARS-CoV-2 – это РНК-содержащий бета-коронавирус семейства Coronaviridae, который был открыт в конце 2019 года в Китае. Он способен вызвать у человека острое респираторное инфекционное заболевание COVID-19 (COronaVIrus Disease 2019).
 
Как правило, инфекционный процесс начинается после проникновения вируса в эпителиальные клетки, выстилающие слизистые оболочки верхних дыхательные путей. В зараженных клетках начинается активная репликация вируса – многократное увеличение числа копий вирусных частиц, или вирионов. Новые вирионы выходят из пораженных клеток и заражают все большее количество здоровых клеток уже не только верхних, но и нижних дыхательных путей. В том числе возможно поражение альвеолярных клеток II типа, что определяет развитие пневмонии.
 
Вирионы SARS-CoV-2 способны проникать в клетки, на поверхности которых присутствует мембранный белок ангиотензинпревращающий фермент II типа (АПФ2, ACE2). Для вируса АПФ2 служит рецептором, с которым связываются гликопротеиновые «шипы» (в состав которых входит Spike- или S-белок), расположенные на поверхности вирусных частиц. Рецепторы АПФ2 представлены на оболочках клеток органов дыхательной и центральной нервной системы, пищевода, подвздошной кишки, почек, мочевого пузыря, сердца. Новый коронавирус способен поражать клетки головного мозга, с чем связывают полную потерю обоняния на ранней стадии заболевания у некоторых пациентов. По некоторым данным вирус также способен проникать в клетки, на мембране которых представлен белок CD147.
 
Количество вариантов SARS-CoV-2 в настоящее время превышает 1000 различных штаммов. «Омикрон» штамм вируса SARS-CoV-2 (линия B.1.1.529) - впервые обнаружен в ЮАР и Ботсване в ноябре 2021. По данным Всемирной организации здравоохранения распространяется быстрее других штаммов.
 
Метод полимеразной цепной реакции, или ПЦР, позволяет в достаточно короткие сроки обнаружить генетический материал – коронавирусную РНК, в незначительном числе клеток эпителия верхних дыхательных путей. Положительный результат (обнаружение рибонуклеиновой кислоты вируса) свидетельствует о том, что в верхних дыхательных путях человека присутствует вирус и человек представляет опасность для окружающих.
 
Инфекция SARS-CoV-2 может протекать бессимптомно (до 50% случаев), в легкой и в тяжелой формах. В последнем случае возможно развитие острого респираторного синдрома (Severe Acute Respiratory Syndrome, SARS) на фоне двусторонней пневмонии. Инкубационный период длится 2–14 суток (чаще 5–7 суток). После чего у пациента появляются симптомы острой респираторной вирусной инфекции (ОРВИ).
 
Все инфицированные коронавирусом, даже те, у кого инфекция протекает в стёртой или в бессимптомной форме, являются источником инфекции уже в первые дни после заражения. Так как они выделяют вирусные частицы в окружающую среду с выдыхаемым воздухом, при разговоре, кашле, чихании. Вирусовыделение в среднем продолжается около 20 суток, однако в отдельных случаях может продолжаться дольше месяца.
 
Важно помнить, что патогенез новой коронавирусной инфекции пока недостаточно изучен. И даже у пациентов, у которых инфекция протекает в лёгкой или стёртой формах, возможно развитие острого респираторного синдрома на фоне пневмонии.
 
Пути передачи и основные симптомы COVID-19
 
Пути передачи инфекции SARS-CoV-2:
  • воздушно-капельный (при кашле, чихании, разговоре);
  • воздушно-пылевой;
  • контактный.
К факторам передачи инфекции относят зараженные воздух, пищевые продукты и бытовые предметы.
 
Инкубационный период составляет от 2 до 14 дней.
 
Клинические симптомы коронавируса (COVID-19):
  • повышение температуры (>90%);
  • сухой кашель, реже с небольшим количеством мокроты (80%);
  • одышка;
  • боль в мышцах, низкая работоспособность, высокая утомляемость (44%);
  • чувство заложенности в грудной клетке (>20%).